【摘 要】
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核小体是染色质结构的基本单位,其在整条DNA序列上的定位分布情况,对于真核生物的基因表达调控起关键作用。用机器学习方法预测核小体定位成为近年来的研究热点。以DNA序列6-
【基金项目】
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内蒙古自治区自然科学基金项目(2015MS0331和2016MS0306)资助
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核小体是染色质结构的基本单位,其在整条DNA序列上的定位分布情况,对于真核生物的基因表达调控起关键作用。用机器学习方法预测核小体定位成为近年来的研究热点。以DNA序列6-mer组分为参数,采用我们提出的多样性增量特征选择技术,筛选出8个6-mer作为分类特征。进一步,采用支持向量机算法,10折交叉检验的总精度达到98.2%。结果表明,核小体定位序列和连接序列核苷k-mer组分的特异化分布,是影响酵母核小体定位的主要因素。
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