实时荧光定量PCR检测多房棘球蚴感染小鼠肝脏丝氨酸蛋白酶抑制基因方法的建立

来源 :中华地方病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:johnlu2828
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目的 建立多房棘球蚴(泡球蚴)感染小鼠肝脏丝氨酸蛋白酶抑制基因(Serpina3g)实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的检测方法及与常规RT-PCR检测方法的比较.方法 肉眼直视下肝脏穿刺注射100 μl泡球蚴组织匀浆液建立泡球蚴感染小鼠模型,3个月后将小鼠处死,Trizol法提取肝脏总RNA,反转录获得cDNA.依据Serpina3g的编码基因(NM_009251)保守序列,通过Primer 5软件设计定量引物,以β-actin作为内参.以健康小鼠肝脏获得的cDNA依次10倍梯度稀释制备标准品(1×10~2~1×10~6 pg),利用SYBR Green RT-qPCR方法检测Serpina3g基因,然后根据cDNA浓度与循环值(Ct)的线性关系,绘制标准曲线,确定RT-qPCR检测的最佳条件和重复性;并将RT-qPCR结果与常规RT-PCR琼脂糖凝胶电泳结果进行特异性、灵敏度和定量等方面的比较.结果 筛选出Serpina3g基因定量引物,最佳退火温度为56.4℃;RT-qPCR无非特异性扩增,标准品及样品熔解温度均在80.5℃,熔解峰单一;标准曲线斜率为-2.833(效率),相关系数r=0.996;5个不同梯度的样本(1×10~2-1×10~6pg)重复检测5次均为阳性,变异<5%;mRNA检出限为1×10~2 pg,总RNA在1×10~2~1×10~6 pg内均可以进行扩增;常规RT-PCR方法mRNA检出限仅为1×10~6 pg.结论 成功建立了小鼠源Serpina3g的PT-qPCR检测方法,在特异性、灵敏度、重复性和定量方面优于常规RT-PCR。

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