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北京市中药科学研究所始建于1971年12月。最初隶属于北京市第一商业局,由北京市药材公司代管。1985年1月1日正式划归北京市医药总公司领导。是一个以中药应用研究为主的市级科研单位。北京市中药科学研究所的前身为“北京市药材公司同仁堂中药提炼厂研究室”。建所初期,所里只有30多间旧平房,人员不足50人,实验场地窄小,设备简陋,技术力量薄弱,主要进行人工合成麝香及中成药新产品的研制工作。建所三年就报批投产中成药新产品5种。1975年进口了一台日本KLA-5型氨基酸自动分析仪,五年间为全国19个省市,近百个单位