【摘 要】
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采用网络药理学合并分子对接的方法预测五味子治疗急性肝损伤的作用机制.在TCMSP和SwissADME数据库中筛选有效成分,使用PharmMapper数据库预测潜在作用靶点并利用Uniprot数据库匹配基因名.利用OMIM、Genecards、NCBI数据库预测急性肝损伤靶点,与药物靶点取交集并构建药物-靶点-疾病网络.将交集靶点导入STRING数据库进行PPI分析并找出核心靶点基因.通过DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto En-cyclopedia of Genes and Geno
【机 构】
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皖南医学院 研究生院,安徽 芜湖241002;皖南医学院 医学信息学院,安徽 芜湖241002;皖南医学院弋矶山医院 安徽省药物临床评价中心,安徽 芜湖241001
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采用网络药理学合并分子对接的方法预测五味子治疗急性肝损伤的作用机制.在TCMSP和SwissADME数据库中筛选有效成分,使用PharmMapper数据库预测潜在作用靶点并利用Uniprot数据库匹配基因名.利用OMIM、Genecards、NCBI数据库预测急性肝损伤靶点,与药物靶点取交集并构建药物-靶点-疾病网络.将交集靶点导入STRING数据库进行PPI分析并找出核心靶点基因.通过DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto En-cyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析,根据KEGG结果构建药物-靶点-通路-疾病网络,并将所有网络图导入Cytoscape软件进行可视性优化.从TCMSP数据库中下载有效成分结构文件,从RCSB PDB数据库下载靶点蛋白骨架,利用Python和AutoDock系列软件进行分子对接验证.共筛选出交集靶点50个,并根据网络互作结果综合分析,药物治疗疾病主要有效成分可能为去氧紫草素、蚕豆酮等;核心靶点有MAPK1、MAPK8、MAPK14、CASP3、PTGS2、AR等;主要涉及PI3K-Akt、FoxO、TNF等信号通路;分子对接各成分与蛋白骨架结合状态良好.五味子通过去氧紫草素、蚕豆酮等有效成分作用于MAPK1、MAPK8、MAPK14、CASP3、PTGS2、AR等靶点来治疗急性肝损伤,调控过程可能和PI3K-Akt、FoxO、TNF等信号通路有关.
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