基于深度学习构建时序基因调控网络

来源 :青岛大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:landgale527
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基因调控是生命体中重要的运行机制,运用深度学习来预测p53相关基因的调控关系对了解基因调控具有重要意义。提出了一种基于卷积神经网络与全连接网络相结合的模型。在ArrayExpress获得了电离辐射Affymetrix数据集(E-MEXP-549)上,可通过微阵列表达水平预测基因间调控关系,为保留的验证集提供92.07%分类准确率,并且该模型的kappa系数达到0.84,AUC验证平均精度达到94.25%,从而构建了带有时延性的p53相关的基因调控网络。研究结果表明,该模型在筛选出已经论证调控关系的基因对上
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