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目的了解新疆南疆地区乡镇卫生院公共卫生功能实施状况，分析其影响因素并提出对策建议。方法采取新疆卫生资源填报系统对南疆喀什、和田地区254个乡镇卫生院进行调查。结果乡镇卫生院公共卫生功能定位不清楚，公共卫生人才队伍结构不合理，政府经费投人不足。结论从明确乡镇卫生院在公共卫生服务中的功能、完善公共卫生经费投入机制、加大农村卫生人力资源建设等三个方面提出对策建议，为政府卫生行政部门提供相关参考。