【摘 要】
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目的探索肝癌差异表达的基因及关键通路,并提供肝癌发生和治疗的生物信息学基础。方法首先使用R语言获得GSE14520数据集中差异表达的基因,通过DAVID数据库进行GO和KEGG功能途
【机 构】
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华北理工大学附属唐山工人医院肿瘤科,华北理工大学公共卫生学院,华北理工大学附属唐山工人医院外科,华北理工大学生命科学学院
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目的探索肝癌差异表达的基因及关键通路,并提供肝癌发生和治疗的生物信息学基础。方法首先使用R语言获得GSE14520数据集中差异表达的基因,通过DAVID数据库进行GO和KEGG功能途径富集分析,使用STRING数据库构建蛋白质间相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape软件筛选核心模块和关键基因,并使用GEPIA,UALCAN,HPA,Kaplan Meier-Plotter数据库分析关键基因在肝癌组织和正常肝组织中的基因及蛋白水平的表达、肿瘤分级和分期的相关性以及预后生存情况。最后使用Metasca
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