【摘 要】
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主要对8周中等强度有氧跑台运动干预的CUMS抑郁小鼠血液与海马组织进行高通量测序,通过m RNA质量监控、文库构建、基因测序与GO、KEGG富集分析等方法进行实验研究。结果:针对3组小鼠血液与海马组织转录组基因测序结果过滤后获得8.28G、8.04G、8.11G、9.15G、9.83G和7.38G高质量序列,经质控完全符合后续实验分析要求。聚类分析发现,3组小鼠血液中共表达基因有36个、海马组织1
【基金项目】
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江西省教育厅科学技术研究项目(项目编号:GJJ2201739、GJJ211637); 江西省自然科学基金重点项目(项目编号:20202ACBL206006); 湖南省教育厅科技重点项目(项目编号:18A045);
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主要对8周中等强度有氧跑台运动干预的CUMS抑郁小鼠血液与海马组织进行高通量测序,通过m RNA质量监控、文库构建、基因测序与GO、KEGG富集分析等方法进行实验研究。结果:针对3组小鼠血液与海马组织转录组基因测序结果过滤后获得8.28G、8.04G、8.11G、9.15G、9.83G和7.38G高质量序列,经质控完全符合后续实验分析要求。聚类分析发现,3组小鼠血液中共表达基因有36个、海马组织16个,这些基因大多参与炎症、免疫调节、细胞凋亡与迁移、信号转导、氧化应激等。血液与海马组织GO富集分析结果显示,2种组织中7个基因涉及到β-淀粉样蛋白沉淀,且这些基因多与神经系统病变、血管病变等密切相关。与运动调控相关基因多参与机体免疫调节、细胞增殖与分化、信号转导、细胞凋亡与抗凋亡等功能,尤其是Apoe、NF-κB、Rtn4等的表达差异显著。2种组织KEGG显著富集结果对比分析也发现,显著富集的通路多与神经元退行性病变、炎症等高度相关。结论:中等强度有氧运动干预诱导CUMS抑郁小鼠血液与海马组织显著富集的差异表达基因主要与长期抑郁、抑郁炎症、细胞凋亡与自噬及其相关信号通路与细胞因子的差异表达较为密切。实验还发现,血液与海马组织显著GO富集基因与KEGG信号通路高度一致,为临床采用血液检测反应海马组织病变及其干预效果奠定实验基础。
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