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摘要：测定了广东省9个水库4株铜绿微囊藻Microcystis aeruginosa、5株水华微囊藻M flos-aquae和4株未定种微囊藻rpoCl基因部分序列，结合GenBank下载的日本5个水体11株铜绿微囊藻、5株绿色微囊藻M．viridis和5株惠氏微囊藻M．wesenbergii同源序列，进行序列分析。结果显示，34株微囊藻存在21种基因型，序列相似性达97．6％～100％。在邻接树上不同形态种和不同地理来源的藻株混杂在一起，没有形成明显的谱系结构和地理结构：同一形态种藻株可能具有不同的基因