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卫生部对医院信息系统（SHI）的定义是，医院信息系统指利用计算机硬件技术、网络通信技术等现代化手段，对医院及所属各部门的人流、物流、财流进行综合管理，对在医疗活动各阶段中产生的数据进行采集、存储、处理、提取、传输、汇总、加工生成各种信息，从而为医院整体运行提供全面的、自动化的管理及各种服务的信息系统。