【摘 要】
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本研究旨在扩增牦牛醛脱氢酶9A1基因的启动子区及编码区全长,检测醛脱氢酶9A1基因在类乌齐牦牛、麦洼牦牛不同组织中mRNA水平的表达规律.本研究采用PCR方法扩增并克隆牦牛ALD
【机 构】
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西南民族大学,青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都,610041;西藏自治区农牧科学院,省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室,拉萨,850009
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本研究旨在扩增牦牛醛脱氢酶9A1基因的启动子区及编码区全长,检测醛脱氢酶9A1基因在类乌齐牦牛、麦洼牦牛不同组织中mRNA水平的表达规律.本研究采用PCR方法扩增并克隆牦牛ALDH9A1基因CDS区及启动子区;通过生物信息学分析软件分析其理化性质、二、三级结构;分析核苷酸序列及氨基酸序列一致性并构建氨基酸序列系统发生树;应用qRT-PCR技术检测ALDH9A1基因在牦牛不同组织中的表达模式.结果 显示,牦牛ALDH9A1基因编码区全长1 485 bp,共编码494个氨基酸,启动子区全长1 034 bp.生物信息学分析发现,牦牛ALDH9A1基因编码的蛋白质是一种结构较稳定、带负电弱亲水性蛋白;同源性分析表明,牦牛与黄牛ALDH9A1基因的核苷酸及氨基酸同源性均较高;系统进化树分析显示,牦牛与黄牛亲缘关系最近,绵羊次之;实时荧光定量PCR结果显示,ALDH9A1基因在牦牛多个组织均有表达,其中肝脏表达量最高且显著高于其他组织(p＜0.05),肾脏和臀大肌次之.本研究为进一步研究和分析ALDH9A1基因在调控牦牛肌内脂肪沉积及机制等方面提供基础数据.
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