【摘 要】
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为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对
【机 构】
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青岛市城阳区农业局,仲恺农业工程学院园艺园林学院,中国热带农业科学院科技信息研究所
【基金项目】
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广东省自然科学基金项目(No.2014A030313593),广州市产学研协同创新重大专项-民生科技专项(No.201704020019),海南省科技合作专项资金“海南省辣椒作物基因型-表型数据深度挖掘技术研究与应用”(No.KJHZ2015-33).
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为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域等进行了预测,同时基于转录组数据集分析了XTH基因在辣椒不同器官、不同发育时期果实中的表达特征。结果表明,辣椒XTH家族包含23个基因成员,不均衡分布在除10号染色体外的其余11条染色体上;23个基因包含1~5个不等的内含子;系统进化分析表明,辣椒
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