人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒血凝素蛋白同源建模与分子进化分析

来源 :黑龙江大学工程学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hjss2008
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血凝素是流感病毒主要的中和抗原,也是流感病毒分型依据之一。为研究人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒血凝素的结构特征和进化历史,从Genl~nk和GISAID数据库获取人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒的血凝素序列数据,用BLAST检索和分层抽样方法分别选取参比序列,进行多重序列比对,构建基于血凝素氨基酸序列的进化树。选取A/Shanghai/02/2013株为代表序列,用同源建模方法构建血凝素蛋白质三维结构模型,分别计算序列比对结果中各氨基酸残基同分类指标的互信息并投射到构建三维结构模型,观察代表性残基的分布
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