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高校专项经费是由财政部、教育部和省、市相关部门,为满足国家、省、市重点工作、重点工程、重点课题等重点研究项目开发的要求,充分利用高校现有科研、设备、知识产权等研发资源和力量而设立的专款专用的经费。为保证经费的合理、合法、合规以及专款使用、专项核算,高校财务部门应规范重视专项资金的预算、拨款、实施、监管等各项业务环节,加强专项经费使用的内部财务管理。文章针对专项经费使用过程中存在的一系列不规范问题,从内部控制角度分析完善高校专项经费使用管理的对策,以实现高校专项经费使用的安全和高效。