目的使用VITEK MS质谱鉴定系统对临床分离的病原菌进行鉴定,并评价其性能,为病原菌的快速鉴定提供新的方法。方法收集2014年4-7月医院临床分离病原菌共948株,经VITEK-2Compact细菌鉴定仪及16SrRNA、rpoB、hisA、ITS基因片段测序确认,使用VITEK MS基质辅助激光解析电离飞行时间质谱进行鉴定,并对8株真菌连续检测测试质谱仪稳定性。结果共分离到链球菌属191株、肠球菌属94株、葡萄球菌属144株、肠杆菌科细菌193株、非发酵革兰阴性菌170株、临床常见其他菌36株、酵母菌属102株和丝状真菌18株。VITEK MS对入选菌株的鉴定总准确率达97.10%,但其对沙门菌属和鲍氏不动复合群的鉴定仅能到菌属或复合群水平;对酵母菌属的准确鉴定率为100.00%,丝状真菌中除链格孢外(数据库未包含此菌),88.89%的丝状真菌得到准确鉴定;VITEK MS质谱仪对真菌连续5d检测结果一致,稳定性良好。结论 VITKE MS表现稳定、准确率高、耗时短,尤其在真菌的鉴定上凸显优势,可作为临床细菌快速鉴定的手段。