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国家和省级主体功能区规划正在编制过程中，主体功能区划是主体功能区规划工作的重要组成部分，而新的《海洋功能区划技术导则》也于2007年5月实施，并将在下一轮的海洋功能区划编制(修编)中应用。为进一步理清海洋功能区划与主体功能区划之间的内在关系，利于两个区划的衔接协调，本文从海洋功能区划与主体功能区划的内涵和划分方法人手，探讨主体功能区划与海洋功能区划之间在区划依据、区划范围、区划单元、区划功能、区划性质、区划作用、管理职能等方面异同，并就二者关系进行简要概括，最后就如何统筹协调主体功能区划与海洋功能区划提出若干建议。