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有关转基因的争端是技术壁垒争端的典型体现之一。欧盟与美国、加拿大、阿根廷的转基因产品纠纷已经持续了20多年，2003年8月29日，WTO争端解决机制（DSB)就此问题设立了单一的专家组。中国保留了作为第三方参加专家组程序的权利。在转基因问题上，中国的利益着眼点主要在于：一方面，要保障中国消费者的安全和利益，防止国外转基因产品的大量涌入，危及我国农业安全：另一方面，要为中国的转基因产品创造良好的国际贸易环境，防止出现针对转基因产品的贸易壁垒，进优势产品的出口。