汉坦病毒浙江分离株ZT71株的全基因核苷酸序列测定及分析

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:stage7
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目的 为了获得浙江省汉坦病毒基因组更为详尽的资料,研究汉坦病毒的进化状况及变异程度,为疫苗病毒株的选择使用提供科学依据.方法 设计特异性引物,RT-PCR分段扩增ZT71株全长L、M和S片段,PCR产物纯化后克隆于T载体并进行序列测定.然后进行遗传进化分析.结果 汉坦病毒ZT71株L、M及S基因分别由6530、3651和1753个核苷酸组成,分别编码2151、1133和429个氨基酸.基因比较分析表明,ZT71株与SEO型汉坦病毒比较其L片段核苷酸同源性为95.5%~99.7%,氨基酸同源性为99.0%~99.3%;M片段核苷酸同源性为84.1%~99.6%,氨基酸同源性为95.3%~99.2%;S片段核苷酸同源性为88.7%~99.5%,氨基酸同源性为96.5%~99.1%;而与其他汉坦病毒同源性则较低.结论 测定了ZT71株的全基因核苷酸序列,其L、M和S片段具有和其他汉坦病毒L、M、S片段相似的核苷酸一级结构,但与SEO型更为接近,属于SEO型病毒.
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