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根据原生动物学家协会出版的最新分类方案,六鞭毛虫隶属于原生动物亚界(Protozoa)六鞭毛虫科(Hexamitidae)[1,2].1838年,Dujardin在研究青蛙肠道里的一种寄生鞭毛虫及积水里两种自由生活的鞭毛虫时,创立了六鞭毛虫属(Hexamita),齐钟彦称为六前鞭虫属[3].Prowazek在研究老鼠肠道里的一种新鞭毛虫时建立八鞭毛属(Octomitus).Lavier根据核鞭毛虫的形态等特征,建立了旋核六鞭毛虫属(Spironucleus)[4].现在,一般认为寄生鱼类的六鞭毛虫均隶属于