生物信息算法可重构加速器技术

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随着生物学原始数据的爆炸性增长,生物信息学迫切需要高性能计算支持.基于FPGA动态可重构算法加速器结合通用处理器的异构计算体系结构能够适应应用程序特征的多样性,同时保持系统软件的兼容性,是高性能计算机体系结构研究领域正在探索的重要发展方向.本研究选取了生物信息学序列与基因组分析领域的若干典型算法,结合应用程序的动态特征,提出了基于FPGA器件的细粒度的并行优化计算结构,并使用动态重构技术实现不同应用之间的快速切换,提高了可重构算法加速器对应用程序的适应性.rn
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