基于基因组突变数据分析肝癌预后分子标志物

来源 :中国癌症防治杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ncsjc

【摘要】

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目的探讨肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)及关键信号通路的基因变异与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的相关性。方法从TCGA数据库及cBioPortal

【作者】

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茅新如刘文斌曹广文

【机构】

：

海军军医大学海军医学系流行病学教研室

【出处】

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中国癌症防治杂志

【发表日期】

：

2019年2期

【关键词】

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肝细胞癌肿瘤突变负荷预后细胞周期调控通路

【基金项目】

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国家重点基础研究计划(973计划)(2015CB554000)

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目的探讨肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)及关键信号通路的基因变异与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的相关性。方法从TCGA数据库及cBioPortal数据库schulze2015队列分别获取376例和243例HCC患者全外显子测序数据,从ICGC数据库获取JP队列 394例及FR 队列250例HCC患者全基因组测序数据。采用生存分析研究TMB、关键信号通路的基因变异与HCC患者预后的关系。结果 TCGA队列、JP队列、sch

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