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以萨曼莎月季为材料，对影响ISSR-PCR扩增的主要影响因子进行了优化，建立了适于月季的ISSR反应体系：25μl反应体积中，1×Buffer、1．5 mmol／L Mg^2＋、1 U Taq DNA聚合酶、0．6 μmol／L引物、0．48mmol／L dNTPs、20ng模板DNA；并将该优化体系应用于其他5个ISSR引物和6个月季品种，证实了该体系的适用性和稳定性。