目的：采用代谢组学的方法和技术比较研究冠心病心血瘀阻证与气阴两虚证的生化代谢产物差异谱。方法：收集符合标准的心血瘀阻证、气阴两虚证冠心病患者各50例，2组受试者上午8点到10点收集尿液标本，应用亲水相互作用超高效液相色谱与四级杆飞行时间质谱技术，比较冠心病心血瘀阻证与气阴两虚证患者尿液的差异性代谢物，结合KEGG通路，研究分析受到显著影响的代谢通路，用机器学习统计分析法探寻特征性生物标志物，从代谢组学角度研究阐明中医证候相关的多因素调节网络。结果：与冠心病气阴两虚证患者相比，冠心病心血瘀阻证患者尿液的显著性差异代谢物有6种，差异代谢物有8种，与上述代谢物相关的代谢通路主要有精氨酸生物合成，缬氨酸、亮氨酸与异亮氨酸的合成，丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢，矿物质代谢等，筛选出冠心病心血瘀阻证的特征性生物标志物2种分别是α-N-苯-L-谷氨酰胺和精氨酸-丝氨酸。结论：尿液代谢生物标记物的变化能在一定程度上区分冠心病心血瘀阻证与气阴两虚证，为冠心病不同中医证型的现代阐述提供了参考。