PRRSV SX-1株的分离与NSP2和ORF5基因的克隆及变异分析

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从山东莘县恒顺猪场发病猪群中分离到PRRSV病毒(SX-1株).用RT-PCR法对该分离株的NSP2和ORF5基因进行了扩增和克隆,并对其进行核苷酸序列测定和分析.结果表明,PRRSV SX-1株的NSP2发生30个氨基酸的不连续缺失,缺失位置与JXA1毒株相同;ORF5基因与JXA1、CH-1a、VR2332核苷酸同源性分别为 98.8%、94.9%、88.9%,氨基酸同源性分别为99.0%、93%、87.5%.基因系统发育树分析结果显示,SX-1与JXA1、HUN株的亲缘关系很近,与CH-1a亲缘关系较近,与VR2332 、CC-1、RespPRRS/Repro MLV等毒株处于不同分支.
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