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旨在为厌氧颗粒污泥微生物多样性研究的开展提供指导，实验以处理果汁废水的厌氧颗粒污泥为研究对象，对PCR—DGGE实验条件进行了优化研究。结果表明：1）采用巢式PCR对厌氧颗粒污泥内细菌与古菌进行扩增，古菌第二轮扩增时退火温度58℃，延伸时间408得到的PCR产物可满足DGGE的要求；2）古菌与细菌的DGGE最优变性剂梯度分别为40％-60％和30％～45％，电泳条件均为80V，16h；3）改进的强碱硝酸银染色法为高效低污染的染色方法。