【摘 要】
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【目的】构建猪基因表达调控数据库(GereDB),为从基因水平解释猪的生长发育规律、遗传育种和疾病防控等提供科学依据。【方法】从NCBI下载小鼠和猪的RNA序列原始数据进行序列
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31902231,31402055),湖北省教育厅青年人才项目(Q20171305),长江大学大学生创新创业训练项目(2018057)
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【目的】构建猪基因表达调控数据库(GereDB),为从基因水平解释猪的生长发育规律、遗传育种和疾病防控等提供科学依据。【方法】从NCBI下载小鼠和猪的RNA序列原始数据进行序列比对,根据序列同源性将小鼠的基因表达调控信息转移给猪,并建立猪基因表达调控信息网络,整理加工后根据区域结构,以Linux为操作系统、Apache为Web服务器、MySQL为数据库、Python为服务器端脚本解释器构建猪GereDB数据库。【结果】从NCBI下载的Fast数据共包含291182条猪核苷酸序列,通过序列比对和手工整理,注
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