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MHCⅡ类分子在向CD4+T细胞提呈经过加工的抗原和诱发免疫反应中起重要作用.MHCⅡ类分子异常表达会引起裸淋巴细胞综合征等严重的免疫缺陷性疾病.目前已知CⅡTA是决定MHCⅡ类分子表达的主要调节因子.此外CⅡTA还影响着自身免疫性疾病、感染性疾病、肿瘤排斥、移植耐受等.因此,Ⅱ类反式激活蛋白作为影响诸多基因的单体蛋白,在干预MHCⅡ类分子提呈抗原途径上是理想的药物治疗靶点。