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肝细胞肝癌是一种最常见的人类恶性肿瘤,其发生、侵袭涉及一系列多基因参与、多步骤协同的复杂过程,通过DNA序列无法解释所有的生物学功能,同样的基因组却表达出不同的蛋白质,显示出不同的生物学功能。在分子水平研究不同临床分期肝细胞肝癌的蛋白质组学对揭示肝癌发生、发展的分子机制有着重要的意义。本文对不同分期的肝细胞肝癌在肿瘤的发生、侵袭、迁移以及早期鉴别诊断、预后、疗效等方面的蛋白质组学研究进行简要综述。