利用伪氨基酸组分和支持向量机预测抗冻蛋白

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lcc2451
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抗冻蛋白是一类具有提高生物抗冻能力的蛋白质。抗冻蛋白能够特异性的与冰晶相结合,进而阻止体液内冰核的形成与生长。因此,对抗冻蛋白的生物信息学研究对生物工程发展。提高作物抗冻性有重要的推动作用。本文采用由400条抗冻蛋白序列和400条非抗冻蛋白序列构成数据集,以伪氨基酸组分为特征,利用支持向量机分类算法预测抗冻蛋白,对训练集预测精度达到91.3%,对测试集预测精度达到78.8%。该结果证明伪氨基酸组分能够很好的反映抗冻蛋白特性,并能够用于预测抗冻蛋白。
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