【摘 要】
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目的 采用生物信息学方法预测和分析布鲁氏菌外膜蛋白Omp31的理化性质、信号肽、蛋白结构和抗原表位,为布鲁斯病基因疫苗的研制提供理论基础. 方法 从GenBank中获取Omp31的氨
【机 构】
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山东省济宁市第一人民医院检验科,山东济宁272000;山东省济宁卫生学校;山东省寄生虫病防治研究所,山东第一医科大学(山东省医学科学院)
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目的 采用生物信息学方法预测和分析布鲁氏菌外膜蛋白Omp31的理化性质、信号肽、蛋白结构和抗原表位,为布鲁斯病基因疫苗的研制提供理论基础. 方法 从GenBank中获取Omp31的氨基酸序列,运用在线软件Protparam分析Omp31的理化性质;采用SOPMA软件预测和分析布鲁氏菌外膜蛋白Omp31的二级结构. 结果 利用在线软件预测布鲁氏菌外膜蛋白Omp31分子式为C1135H1725N297O354S4,脂溶性指数为87.31,蛋白质的疏水值为63.26,理论pI值为8.61,原子总数为47 900;其氨基酸序列Gly(G)占12.9％,Ala(A)占11.7％.正电荷残基(Arg+ Lys)、负电荷残基(Asp+ Glu)总数分别为19和24,其不稳定系数48.25.该蛋白为稳定蛋白,亲水性系数GRAVY为-0.091.Omp31无跨膜区域,属于水溶性蛋白,其中无规则卷曲较多,位于蛋白表面.蛋白质中大部分氨基酸可以形成一定的结构域,抗原性总预测值为0.632 4. 结论 生物信息学分析鲁氏菌外膜蛋白Omp31含有多个抗原表位,可能具有免疫原性,表明该蛋白可作为潜在抗原用于疫苗的研制.
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