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采用扩增片段长度多态性AFLP标记对国内外31个杧果主要品种进行分类与亲缘关系研究。结果表明:筛选出的14对引物组合在31份杧果种质中共扩增出了1761条带,其中多态性带的比例为97%。平均每对引物产生125.8条带和121.6条多态性带,总的多态性带率为97%;基于AFLP标记,以0.48的相似系数为阈值,所有供试杧果材料被分为7大组群,第一组群内以0.52为阈值,又可分为6组。与形态标记相比,基于AFLP标记的杧果分类体系更能反映杧果品种间的亲缘关系。