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1232年（壬辰），蒙古军队包围汴京，金哀宗弃城出逃，后汴京城陷，史称壬辰之变。壬辰之变对李东垣身份、地位及学术思想影响巨大。李东垣由一名生活优裕的儒士变为阶下囚，且迫于生存压力，不得不专事于医。李东垣亲见蒙军围汴京之时，城中有近百万人死亡。许多人认为是疫病所致，但他经过深入思考，认为此多为“药误”所致。是由惊惧、饥馑、劳役之下，饮食太过，感而伤人。城中诸医未认识到病人脾胃已伤，反以治外感病之法治疗，导致病人死亡。亲历壬辰之变的李东垣立补中益气之法，完善了脾胃内伤学说。