日本沼虾多态性标记筛选及群体遗传结构分析

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从转录组测序数据中筛选重复次数较多、两翼序列较长的简单重复序列用于多态性EST-SSR标记的筛选,利用荧光标记SSR技术分析太湖、长江下游(崇明岛附近)、微山湖和东平湖4个地理群体日本沼虾的遗传多样性。从日本沼虾转录组测序数据中选择546个cDNA序列,设计了60对引物,有33对能扩增出稳定、清晰的条带,其中12对呈现出良好的多态性。这12个多态性微卫星标记的等位基因数为3~7,观测杂合度为0.1724~0.9630,期望杂合度为0.1942~0.8462。群体遗传多样性分析结果显示,微山湖群体的平均期望
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