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分析比较临床1例重症肺炎患者痰标本培养出的平滑型脓肿分枝杆菌（MabS）和粗糙型脓肿分枝杆菌（MabR），并进行药敏试验研究，为临床诊断治疗提供科学依据。对MabS和MabR进行菌体形态观察、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）和16S rRNA基因序列测序比对，构建系统发育进化树进行同源性分析，并采用比例法和肉汤法进行体外药敏试验。MabS和MabR菌落形态不同，MALDI-TOF MS分析MabR有223个蛋白峰，MabS有147个蛋白峰。16s RNA基因测序MabS为1 397 bp，MabR为1 402 bp，药敏试验显示二者对抗结核药几乎耐药，对绝大部分抗菌药物敏感。MabS和MabR对抗结核治疗药物普遍耐药，而对抗菌药物几乎敏感，联合使用抗菌药物治疗有较好的疗效，可供临床参考。