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铜华山金矿处于塔里木板块北边缘汗腾格里—库米什推覆大断裂南侧的南天山成矿带萨阿尔明—库米什金、铜矿带。赋矿岩性为泥盆系阿拉塔格组下亚组一套陆源碎屑岩建造,断裂构造控制着蚀变带和金矿体的分布。泥盆纪地层提供了较为丰富的金元素来源,岩浆侵入提供了热源,断裂提供了导矿和容矿空间。成因类型为岩浆热液型金矿。