论文部分内容阅读
提出一种基于“块-单元-链表”数据结构和HSFC动态负载平衡的并行分子动力学算法，实现了大规模、非均匀分子动力学模拟的基于MPI的可扩展并行计算，以辅助物理学家实现具有实验意义的纳米级模拟。具体地，在某MPP并行机的240个CPU上，计算3．84亿(二维)和2．76亿(三维)个粒子规模的金属微喷射问题，均获得了209倍以上的加速比。