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通过克隆和测定核糖体DNA内转录间隔区（Ribosomal DNA internal transcribed spacer,rDNA,ITS）基因序列,研究红榉不同种源间的亲缘关系。测定结果表明：红榉5个种源的ITS序列、ITS1和ITS2长度变异范围分别为561～623 bp、157～210 bp和215～222 bp。软件DNAMAN、遗传距离和UPGMA法系统发育树分析结果表明：南京种源与赣州种源的亲缘关系较近,湖州种源与怀化种源的亲缘关系较近;滁州种源单独聚为一类,与湖州、怀化种源的亲缘关系较远。