抗肿瘤蛋白数据库的建立及其在海洋小分子化合物反向寻靶中的应用

来源 :中国海洋药物 | 被引量 : 0次 | 上传用户:flywate
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 建立1种快速高效的反向寻靶的计算机模拟方法,用来预测具有抗肿瘤活性的海洋小分子化合物潜在抗肿瘤靶点.方法 利用生物信息学手段,通过寻找与肿瘤相关的调控蛋白和抗肿瘤的靶标蛋白,构建出1个小规模的抗肿瘤蛋白数据库,建立1种比较准确的计算机反向寻靶的方法,并通过已知实验数据验证该方法的可靠性.结果 借助计算机软件模拟分子与靶蛋白的对接,发展了1种基于结构的反向寻靶的计算机模拟方法.结论 结果显示该方法能准确、快速且廉价的预测配体小分子与靶标蛋白的结合情况,从而加速了海洋小分子化合物抗肿瘤靶点的寻找.“,”Objective To establish a fast and efficient computational approach for reverse target finding of the marine small molecular compounds with antitumor biological activity.Methods This experiment mainly used the method of bioinformatics,through finding proteins related to tumor,to construct a small scale antitumor protein database,and established an accurate computational reverse target finding approach.The accuracy of this method was validated through the known experimental data.Results A computational reverse target finding method was developed based on structural molecular docking.Conclusion The known experimental results showed that this method could fast,accurately and economically predict the probable targets of the marine small molecular compounds for speeding up the search of the antitumor target.
其他文献
《中国药典》一部1995版将人参、红参分列为二个药,麦冬、山麦冬,半夏、法半夏,川乌、制川乌,甘草、炙甘草,水牛角、水牛角浓缩粉,红芪、制红芪,地黄、熟地黄均已分立.这是药
会议
  2000年版已公布近4年,深受药学工作者欢迎.本文对2000年版内容提出几点意见供参考.1.关于"一药一名"的问题;2.中的天然化学药物问题。
目的 构建海南产桶形芋螺毒管cDNA文库,为桶形芋螺毒素基因资源的永续保存和新型药物的研发提供依据.方法 以总RNA抽提试剂盒,从桶形芋螺毒管中提取总RNA,采用SMART技术,LD-P
教师能否受到学生以致全社会的尊重的前提是教师必须尊重学生,从正确认识学生的心理特点和认识规律以及严格要求学生和正确教育引导学生方面阐述了教师对学生的尊重.
目的研制一种壳聚糖衍生物并探讨其应用于生物医学工程的可行性。方法将高相对分子质量的壳聚糖通过纤维素酶降解,产生平均相对分子质量在100 kD~250 kD左右的低相对分子质量
目的研究壳寡糖对雌二醇诱导的人乳腺癌MCF-7细胞分泌促肿瘤血管生成因子的抑制作用。方法采用MTT法检测处理24和48 h后壳寡糖对正常乳腺癌MCF-7细胞生长的影响;采用RT-PCR方
目的对来源于沙蚕(Perinereis aibuhitensis)的硫酸多糖进行结构表征和抗凝血活性研究。方法采用两步酶解法从沙蚕中提取多糖;利用强阴离子交换色谱和凝胶渗透色谱对粗多糖进
  本文论述了胃和食管内镜活检的重要性,常见检材:胃黏膜和食管黏膜内镜活检分别占外检量的1/4~3/1和1﹪左右,提出了重视积累诊断经验8随时警觉制片-诊断流程失误,警觉诊断形成
  本文介绍了所有肿瘤及其变型均严格地按疾病来描述诊断标准、病理学特点和相关的遗传学改变,包括新的ICO-D编码、发病率、年龄和性别分布、部位、临床症状和体征、病理学
目的从1株中国南海西沙群岛软珊瑚来源的真菌Pestalotiopsis sp.(ZJ-2009-7-6)中分离鉴定具有生物活性的3-苯基苯并呋喃酮化合物。方法运用多种色谱分离手段和现代波谱分析方