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随着新一代测序技术的不断发展，海量的序列数据将为生物学研究者挖掘基因信息提供巨大的资源．信息挖掘的一项重要工作是对序列进行功能注释，其中最重要的功能注释方式是基因本体论（Gene Ontology，GO）的注释．利用生物信息学方法和软件工具集成了针对EST序列的大规模GO注释流程（1arge—scale GO annotation pipeline，LSGAP）．该流程集合了BLAST、B2g4pipe以及Wego等软件和Swissprot、Nr或Interpro等常用蛋白数据库．用户可以将EST序列通过