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利用FreeBSD操作系统的文本过滤命令将NCBI的Genbank数据库的EST序列实现本地化导入到MySQL数据库中并能够进行更新，这利于对不同物种不同组织器官基因表达的分析。以水稻EST数据为例，对EST序列两端出现的polyA／T和载体序列亦进行了鉴别及去除，经过预处理的EST序列数据将为进一步进行EST聚类及基因表达分析提供可靠的保证。