基于计算机分子模拟技术的PD-1单克隆抗体的抗原表位预测及初步验证

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户:benben8383
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的利用计算机分子模拟技术对筛选获得的四株鼠源程序性细胞死亡受体1(PD-1)单克隆抗体的抗原表位进行预测并通过实验对预测结果进行初步验证。方法通过Discovery Studio(DS)分子模拟工作站的Model Antibody模块分别构建四株PD-1抗体3D1、1C7、2F6、2E7的三维立体模型。利用DS软件中ZDOCK和RDOCK模块,将所得四株抗体模型分别与PD-1晶体模型(PDB ID:3RRQ)进行生物大分子模拟对接和结合表位分析,得到四株抗体的抗原表位预测结果,并通过Western bl
其他文献
外泌体在卵巢癌的血管生成、细胞增殖与转移、免疫调节与化学耐药中发挥重要作用。铂类耐药分为靶前耐药、靶上耐药、靶后耐药及脱靶耐药。外泌体靶前耐药相关机制主要包括转移药物输出蛋白、降低细胞内药物浓度,促进上皮细胞间充质化,运输解毒剂或排出细胞中有害物质。外泌体可通过提高circ RNA富集程度、促进DNA甲基化参与卵巢癌的铂类药物靶上耐药。外泌体可通过选择性携带耐药相关miRNA、改变卵巢癌细胞微环境参与细胞凋亡,参与卵巢癌的铂类药物靶后耐药。外泌体中miR-21、miR-223、mir-214可通过磷脂酰肌
慢性肾脏疾病-矿物质和骨代谢疾病(CKD-MBD)是由慢性肾脏病(CKD)引起的全身矿物质和骨骼代谢紊乱,并有血钙、血磷、甲状旁腺激素(PTH)、维生素D代谢异常及骨转换、矿化、体积、线性生长、强度异常、血管或其他软组织钙化等表现。在CKD-MBD发病机制的经典假说中,PTH及钙、磷水平的失调与继发性甲状旁腺功能亢进的发展密切相关,而成纤维细胞生长因子23(FGF23)的出现彻底改变了对继发性甲状旁腺功能亢进发病机制的理解,FGF23、跨膜蛋白Klotho、Wnt抑制剂、激活素A等在CKD-MBD的发病过
目的观察依达拉奉右莰醇对急性前循环脑梗死血管内治疗开通良好患者的脑损伤的改善作用。方法60例急性前循环脑梗死患者,均行血管介入术(支架取栓联合中间导管抽吸)治疗,分为观察组和对照组,每组各30例。介入术后观察组予依达拉奉右莰醇注射液37.5 mg+100 mL生理盐水静脉滴注,2次/天;对照组患者给予依达拉奉30 mg+100 mL生理盐水静脉滴注,2次/天。分别于术前、治疗后第2天、治疗第7天及第14天采用NI-HSS评分评估两组神经受损情况,于治疗第14天采用mRS评分评估生存质量。两组分别于术后第2
目的采用长链非编码RNA(lncRNA)芯片检测HBx转染的肝癌Huh7细胞中的mRNA和lncRNA,筛选差异表达mRNA和lncRNA,并分析其功能。方法培养Huh7细胞,分为野生型HBx(HBx-FJ)组和pcDNA3.1组,分别转染pcDNA3.1-HBx-FJ、pcDNA3.1。采用lncRNA芯片检测两组Huh7细胞中的mRNA和lncRNA表达谱,以折叠倍率≥2.0、两组差异有统计学意义(P<0.05)、错误发现率<0.05判定为差异表达基因;用散点图和分层聚类分析差异表达的mR
目的比较加温湿化高流量鼻导管氧疗(HFNC)与经鼻连续气道正压通气(nCPAP)辅助治疗小儿重症肺炎呼吸衰竭的效果。方法52例重症肺炎并呼吸衰竭患儿,随机分为HFNC组、nCPAP组,每组各26例。两组均予抗生素、支气管舒张剂、纠正水电解质失衡等常规治疗,HFNC组在此基础上采用高流量给氧模式治疗,氧气浓度40%~60%,氧气流量2 L/(kg·min),温度34℃~36℃,湿度>99%。nCPAP组在常规治疗基础上加用连续气道正压治疗,氧气浓度40%~60%,氧气流量8~20 L/min,压力4~
目的 基于数据挖掘技术和网络药理学分析中医药治疗布鲁氏菌病的用药规律及药物作用机制.方法 收集治疗布鲁氏菌病患者的1095张有效中药处方,通过Microsoft Excel软件对处方
表皮生长因子受体(EGFR)、血管内皮生长因子受体(VEGFR)、肝细胞生长因子(HGF)及其受体c-Met、胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)以及磷脂酰肌3-激酶/蛋白激酶B/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(PI3K/AKT/m TOR)等可作为头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的治疗靶点。EGFR抑制剂分为靶向作用于细胞外配体结合域的单克隆抗体(西妥昔单抗、帕尼单抗及扎鲁木单抗等)和作用于细胞内酪氨酸激酶结构域内ATP结合位点的小分子酪氨酸激酶抑制剂(吉非替尼、厄洛替尼和拉帕替尼等)两大类。VEGF/VEGF
目的检测并分析耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)产碳青霉烯酶基因型及其同源性。方法对2020年湖北省十堰市3家三甲医院临床分离的31株CRECO采用MALDI-TOF质谱仪进行菌种再鉴定,K-B纸片扩散法和E test条复核药敏结果,得到23株CRECO。采用碳青霉烯类药物的协同试验初筛产碳青霉烯酶基因型,PCR法检测8种常见碳青霉烯酶基因型并对阳性产物测序,用肠杆菌科基因间重复一致序列(ERIC)PCR法检测其同源性。结果23株CRECO中,9株产NDM-5酶,6株产KPC-2酶,2株产IMP-4酶。
目的观察miR-519d对绒毛膜滋养细胞增殖、侵袭及迁移能力的影响,并探讨可能的作用机制。方法体外培养人绒毛膜滋养细胞HTR-8/SVneo,将HTR-8/SVneo细胞分为实验组和对照组,分别转染miR-519d mimics和NC-mimics,采用CCK-8实验检测两组细胞增殖能力,Transwell实验检测细胞侵袭、迁移能力,采用Westernblotting法检测细胞中基质金属蛋白酶2(MMP-2)蛋白。应用双荧光素酶报告基因实验验证miR-519d与MMP-2的靶向关系。结果实验组细胞增殖、侵
目的观察过量维生素D3(VitD3)灌胃的Wistar大鼠毒性反应及组织器官钙化情况。方法将6~8周龄Wistar雄性大鼠分为给药组和对照组,每组20只,给药组给予VitD370万U/kg灌胃,对照组同法给予等体积蒸馏水,隔天1次,共灌胃2次。灌胃后记录大鼠一般情况,并于灌胃结束1周后取大鼠心脏、肝脏、肾脏、肺、血管进行HE染色,观察组织病理变化;茜素红染色观察组织器官钙化情况;qRT-PCR法检测骨形态发生蛋白2(BMP2)mRNA,免疫