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目的：探讨临床药学指导在细菌性肺炎治疗中的应用效果。方法选取本院2012年4月~2014年4月收治的80例细菌性肺炎患者作为研究对象，随机分为观察组与对照组，各40例。对照组给予常规用药处理，观察组给予临床药学指导干预，全面监控治疗过程中抗生素的使用情况，比较两组的治疗效果与抗菌药耐药率。结果观察组的总有效率为82.5%，显著高于对照组的57.5%，差异有统计学意义（P〈0.05）。观察组的耐药率显著低于对照组，差异有统计学意义（P〈0.05）。结论临床药学指导在细菌性肺炎治疗中的应用效果显著，能够提高治