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马尾松可育珠鳞集生于球果中、上部,不育珠鳞集生于球果下部,两者分别占球果总鳞数的58.4%和41.6%。可育珠鳞中仅部分胚珠发育正常,其余呈不同形态的败育。胚珠败育发生在大孢子母细胞、雌配子体游离核及全细胞化的三个时期。败育胚珠占球果总鳞数的21.7%。花粉粒各发育阶段因低温冻害败育,导致花粉发芽率降低50%左右。由于异常气候的影响,造成胚珠败育和种实发育不良,使饱满种子显著少于正常年份。