查岗诺尔铁矿区位于西天山伊犁地块东北缘博罗科努山系的主脊线上,属中天山北缘活动陆缘带。该矿区位于破火山口的西北缘,矿体产状受火山穹窿构造的制约。赋矿围岩为下石炭统大哈拉军山组安山岩及安山质火山碎屑岩。该矿床的成矿期可划分为矿浆期和热液期,隐爆作用伴随成矿全过程。矿浆成矿期形成了浮渣状、斑点状、致密块状、贯入角砾岩状和阴影状等矿石;热液成矿期形成了对称条带状、复角砾状及网脉状等矿石。矿石的稀土元素球粒陨石标准化配分曲线均属向右倾的轻稀土元素富集型,微量元素表现出特征的Nb、Ta亏损和大离子亲石元素富集。矿石的稀土元素和微量元素总体特征与安山岩一致。矿石和安山岩的Pb同位素数据在Pb同位素比值图上共线。安山质火山岩中普遍含有数量不等的磁铁矿。这些特征都表明了矿石与安山岩的亲和性。矿石的氧同位素组成与典型的岩浆型矿床相一致。该矿床属以安山质岩浆为母岩浆的岩浆矿床(主要)和热液矿床(次要)的复合型矿床。