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巴楚断裂位于塔里木盆地中央隆起带西段，经历了古生代拉张断陷，中，新生代挤压隆升的正反转构造演化历史，早古生代，巴楚地区位于克拉通内坳陷的南翼，晚古生代，西段为－ＮＷ向的低隆，东段仍是阿瓦提凹陷的一部分；中生代形成断隆雏形，新生代形成现今西高东低，北高南低的前缘断块隆起，其主要构造反转期为第三纪，巴楚断隆的发育极大地受南到北两凹陷沉降的影响，其成因主要是由于板块碰撞和走滑断裂活动所形成的剪切挤压所致