辽宁省番茄上番茄斑驳花叶病毒的分子鉴定

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为明确2015年在辽宁省调查番茄病毒病时发现的病毒类型,对田间采集的番茄病样进行了分子检测.结果显示,在用烟草花叶病毒属通用检测引物进行RT-PCR扩增时22份样品中有6份扩增到800 bp左右的目的片段,扩增产物测序后BLAST分析结果表明它与已报道的番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToM-MV)(KF477193)同源性最高,为99.2%.为进一步确认,针对ToMMV编码的外壳蛋白(CP)设计了一对特异性引物,对样品进行RT-PCR检测,结果显示6份阳性样品都能扩增到目的条带,对其克隆测序后发现CP基因序列全长480 bp,编码1个相对分子质量约1.77×104的蛋白质,系统进化树表明该病毒与ToMMV的同源性最高,共同聚类于一个分支.这些结果表明在辽宁省番茄病株上检测到的病毒为ToMMV的1个分离物,这是在辽宁省番茄上发现番茄斑驳花叶病毒的首次报道.
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