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采用限制性内切酶HaeⅢ、BstYⅠ分别对鲁西黄牛、渤海黑牛、盱眙水牛和中国荷斯坦奶牛MHC-DRB3．2基因的半巢式PCR产物进行酶切。结果表明：4个群体均在HaeⅢ酶切位点上表现多碱基突变，盱眙水牛等位基因数少于其他3个群体；鲁西黄牛、渤海黑牛和中国荷斯坦奶牛在BstYⅠ酶切位点上表现多碱基突变，而盱眙水牛未检测到突变；Х^2适合性检测表明鲁西黄牛、盱眙水牛2个群体在HaeⅢ酶切位点上碱基突变偏离Hardy-Weinberg平衡状态，中国荷斯坦奶牛在BstYⅠ酶切位点上碱基突变也偏离Hardy-Wei