论文部分内容阅读
目的
建立类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(rheumatoid arthritis fibroblast like synoviocytes ，RA-FLS)背景特异性的microRNA -靶基因和microRNA-小分子互作网络。
方法利用microRNA PCR Array数据(GSE72564)筛选出RA-FLS和骨关节炎对照样本中差异表达的microRNAs，整合多个microRNA-靶基因互作数据库，构建RA-FLS差异表达microRNA与靶基因的功能调控网络；整合microRNA-小分子互作数据，构建RA-FLS差异表达microRNA-小分子调控网络，计算网络中心性，获得核心调控microRNA及小分子药物节点。
结果获得RA-FLS差异表达microRNA 63个，建立RA-FLS背景特异性的microRNA -靶基因和microRNA -小分子互作网络，筛选出hsa-let-7b-5p、hsa-mir-15b-5p、hsa-mir-218-5p、hsa-mir-30a-5p、hsa-mir-520d-3p五个关键microRNA，5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)、glucose、1，2，6-Tri-O-galloyl-beta-D-glucopyranose(TGGP)、糖皮质激素(glucocorticoid)四种与RA-FLS密切相关的活性小分子。
结论RA-FLS背景特异性的microRNA-靶基因和microRNA-小分子互作网络的构建，尤其是中心性microRNA和小分子的筛选，有望成为RA-FLS研究的潜在靶点。