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在国民经济可持续发展中,生态环境系统的维持、恢复和重建是最重要的治本内容之一.如何在工程项目中评价其生态环境系统的作用,是一个亟待解决的问题.从生态环境的内涵定义出发,对其生态环境系统中的自然资源核算体系进行了分析,给出了评价生态环境系统的途径和方法,探讨了生态环境建设与经济最优化和效益最大化的关系.