【摘 要】
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目的:利用生物信息学方法对热带无爪螨第1组分变应原(Blo t 1)特征进行分析.方法:采用SignalP 4.1服务器用于分析Blo t 1的信号肽序列,ProtScale tools对Blo t 1的理化性质进行分析,Net?Phos3.1服务器预测分析Blo t 1的磷酸化位点.采用SOPMA服务器预测其二级结构.结果:Blo t 1是一种亲水蛋白,其第1-18位氨基酸为Blo t 1的信号肽序列,磷酸化位点预测显示:Blo t 1含有16个丝氨酸激酶、12个苏氨酸激酶及16个酪氨酸激酶,没有跨膜结
【机 构】
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江苏医药职业学院基础医学部,江苏盐城 224005
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目的:利用生物信息学方法对热带无爪螨第1组分变应原(Blo t 1)特征进行分析.方法:采用SignalP 4.1服务器用于分析Blo t 1的信号肽序列,ProtScale tools对Blo t 1的理化性质进行分析,Net?Phos3.1服务器预测分析Blo t 1的磷酸化位点.采用SOPMA服务器预测其二级结构.结果:Blo t 1是一种亲水蛋白,其第1-18位氨基酸为Blo t 1的信号肽序列,磷酸化位点预测显示:Blo t 1含有16个丝氨酸激酶、12个苏氨酸激酶及16个酪氨酸激酶,没有跨膜结构域;Blo t 1的二级结构中包含α螺旋(氨基酸占比28.56％),β转角(氨基酸占比7.95％),延伸链(氨基酸占比19.05％)和无规则卷曲(氨基酸占比44.44％).Blo t 1的B细胞表位有5个肽序列(38-43,115-118,125-130,156-159,204-212),T细胞表位预测得到3个肽序列(89-109,134-154,247-267).结论:对Blo t 1的表位分析,为Blo t 1基于表位的疫苗和肽-ELISA的研发奠定理论基础.
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